双凤中心小学的前身是建于清同治七年（1868年）的双凤镇义塾，光绪三十年（1905年）改设双凤乡第一初等小学堂，校舍迁至李家桥堍“育婴堂”（即现在校址），民国十五年（1926年）建立双凤镇中心国民学校。1949年5月11日双凤解放，在党和政府的关怀下，1951年取名为“太仓县双凤中心小学”。

2008年9月搬至新校区，新校区占地总面积为17100平方米，建筑面积6687平方米，有2幢教学楼、一幢专用教室楼、一幢综合楼，校舍整齐而典雅，亮丽的校貌悦目赏心，环境优美，设施齐全，2009年学校就被评为了苏州市教育现代化学校，通过近两年的不断完善，已达江苏省一类、苏州市高水平教育现代化学校的标准，为师生的教育教学活动提供了良好的条件。