常熟站为在建沪通铁路和规划沿江城际铁路共用车站，总规模按3台8线控制，站房总规模按20000平方米控制：其中沪通场为2台4线，站房建筑面积按11000平方米控制；南沿江场为2台4线（其中与沪通场公用1台），站房建筑面积按9000平方米控制。

沪通铁路东西向穿越常熟市常福街道、琴川街道、海虞、古里、梅李、董浜和支塘五镇，并在主城区东北部设客运常熟站。沪通铁路江苏境内沿线设平东站、南通西站、张家港北站、张家港站、常熟站、太仓港站、太仓站等站。

按规划方案，常熟站主要办理客运作业中间站，站房主体一层，局部二层。一层主要设置旅客活动平台、主入口、候车大厅、商务候车室、售票厅、出站厅及其它配套服务设施。二层设置旅客服务设施。