元朝延祐年间（公元1314-1320年），道士苏斗南重建，并升院为观，取名灵应观。

灵应观现存遗址东西向长146米，南北向135米，面积近20000平方米。观前有一小河，东接阳澄湖，西达济民塘，是当时四乡祟米者的重要水路交通干道，河上有一重建于光绪年间的单孔石拱桥——观桥(通仙桥)，为市级文物保护单位。据镇上老人回忆，当年的灵应观头山门有一砖砌牌楼，气派不凡，观内自南向北分别为雷祖殿、三观殿、玉皇殿、三清殿等主要建筑。两边还建有不少供道众使用的厢房，观中另有古银杏、荷花池等景观。

灵应观古观环境清静幽雅。远者，北望虞山，玉山虎丘，东西遥峙。近者，阳澄湖、尚泽湖，分立观南东西两侧。北通昆承湖。观周四溪环绕，宛如玉龙盘观。灵应观深藏于青山绿水间。实为修道之佳地。

据明碑《灵应说》载：“宋度宗咸淳二年，始祖赵志清奉敕募缘创建。初名灵应道院。元时苏斗南重建后，请升院为观。乃名灵应观。距今逾七百四十余年。

古观精心设计，以道家信物仙鹤为蓝本。单孔石拱通仙桥为鹤首。青砖铺砌长甬道是鹤颈。祖师殿、三宫殿、玉皇殿、三清殿成一直线，由走廊连成一体，组成鹤身。东西厢房为鹤翅。千年古杏作鹤尾。观东部是花园。建有荷花池、湖心亭、九曲桥、石塔、古井；僻花圃菜园。四周遍植翠柏，四季花香。观内原有三大镇观宝物，即独身楠木玉帝法像、金书法经、苍老古银杏。此外尚有通仙宝坊、砖砌楼等众多古碑，可惜至今已大都淹没无存。

古观历代高道辈出。法术高强，能呼风唤雨者，苏斗南也。博学多艺，授出高徒姚广孝者，席应真也。奉诏进京论道，名震京师者，周鹤林也。跋涉千里，立志修观者，赵弘科周正谊也。求雨应验，苏府授匾，法力回天者，高科升也……